現山門原為報國院之正門，為僅存的明代建筑。九十年代重修時，改為藏海寺的山門，而將報國院真武殿西移重建于今址。門額“藏海寺”三字為中國佛教協會會長趙樸初親題。兩側有于右任早年手書唐王維《青龍寺》聯語：“山河天眼里；世界法身中”。筆走龍蛇，金碧輝煌。

山門內正中廣場，古銀杏樹高聳入云，寶鼎中香煙不絕。藏海寺大雄寶殿今已題名為“普光明殿”，莊嚴雄偉。趙樸初為大殿題“三千覺路”匾，楹聯為錢仲聯撰書，語曰：“自天水建庵，石劫幾回經，法日重光千祀后；當赤明開紀，化城彈指現，蜀峰飛到一燈前。”普光明殿中如來佛像，法相莊嚴，一尊玉佛，由信女王鳳和捐資6萬，余則由興福寺出資恭請。殿中護法諸天和大悲殿中的千手觀音像均由浙江寧波佛像研究所塑制。

大殿之東“大悲殿”匾由趙樸初題額，東有“三藏法輪”匾，謝稚柳所題；殿內有“眾善奉行”匾，啟功題。茗山法師為此殿題寫楹聯：“無我相無人相無眾生相無壽者相；有悲心有慈心有歡喜心有大舍心。”

大悲殿再向東原為拂水東庵址，現辟為東園，草坪、水池、曲廊、花木，參差起落有致。乾隆年間《祖師廟歸僧收管碑記》及1995年《重建藏海寺碑記》分別立于曲廊之壁。舉凡寺廟沿革、歷代廢興、重建經過以及景觀特點、命名含義等均有概記。兩件新舊文物，成為寺廟之歷史見證。

藏海寺向西一墻之隔為報國院，院內有真武殿，殿前另有庭院和殿門。殿宇正中供奉真武神像，由信徒自發送供。左右有重翁所撰楹聯：“靈殿溯明清，德被嚴相堂前，庶民仰止；洞天攬吳越，風回尚父湖畔，塵世肅然。”